Libeskind-Hadas, Wu, HMC学生发表生物信息学论文
2020年12月16日
由Harvey Mudd学院计算机科学教授Ran Libeskind-Hadas和Yi-Chieh " Jessica " Wu及其研究生进行的有关基因和物种进化的研究发表在 生物信息学, 一本主要关注基因组生物信息学和计算生物学新发展的杂志.
桑蒂·桑蒂查维金22岁, Rose Liu, 22岁, Qing Yang’23, 罗斯·马沃特18年, 23岁的Trenton Wesley和23岁的Justin 姜是该论文的共同作者, 皇后:一个系统的共生系调节工具,，详细介绍了他们一直在开发的软件工具. 近年来，许多其他HMC学生也为这个项目做出了贡献.
达尔文写道，他可以想象成对的物种, 比如花和蜜蜂传粉者, 可能会共同进化，这样两个物种就能相互适应和适应. “共同进化出现在共生体中, 例如植物和它们的传粉者以及寄主和寄生虫以及其他对相关实体,里伯斯金-哈达斯说. “我们正在研究的问题是‘调和’成对的进化树，以解释一对给定的分类群是如何共同进化的.”
HMC研究小组和其他人已经开发了几种有效的算法来确定如何协调树对并分析这些协调. eMPRess软件工具将这些算法集成到一个单一的软件工具中，供生物学家使用.
学生们做出了重要贡献. Santichaivekin, 谁负责监督实现女皇的软件开发团队, 在过去的几年里，他与Mawhorter和Libeskind-Hadas合作开发了几种算法. Mawhorter和Liu也对算法的实现做出了贡献. 姜, Yang和Wesley开发了eMPRess软件工具的图形元素，以帮助可视化和使用.
